Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ccdc113Q8C5T8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms