Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek11Q8C0Q4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms