Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms