Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms