Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms