Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gga3Q8BMI3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gga3Q8BMI3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gga3Q8BMI3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gga3Q8BMI3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gga3Q8BMI3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gga3Q8BMI3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms