Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem39bQ810L4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39bQ810L4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms