Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms