Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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