Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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