Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc1Q80VQ1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms