Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnphQ80U23 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnphQ80U23 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms