Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnf1Q7TSH7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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