Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms