Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms