Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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