Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms