Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Rph3alQ768S4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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