Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cspg5Q71M36 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cspg5Q71M36 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cspg5Q71M36 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cspg5Q71M36 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cspg5Q71M36 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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