Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynmQ70IV5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms