Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms