Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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