Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp49Q6P9L4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp49Q6P9L4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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