Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms