Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4Q6P1D7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slx4Q6P1D7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slx4Q6P1D7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slx4Q6P1D7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slx4Q6P1D7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4Q6P1D7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4Q6P1D7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4Q6P1D7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4Q6P1D7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms