Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mvb12bQ6KAU4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mvb12bQ6KAU4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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