Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt39Q6IFX4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms