Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms