Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms