Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms