Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

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Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Sbno1Q689Z5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Sbno1Q689Z5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Sbno1Q689Z5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sbno1Q689Z5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Sbno1Q689Z5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Sbno1Q689Z5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Sbno1Q689Z5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sbno1Q689Z5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms