Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms