Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc18Q640L5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc18Q640L5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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