Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms