Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms