Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pacsin1Q61644 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pacsin1Q61644 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pacsin1Q61644 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pacsin1Q61644 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pacsin1Q61644 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin1Q61644 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pacsin1Q61644 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms