Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms