Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CttnQ60598 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CttnQ60598 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CttnQ60598 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CttnQ60598 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CttnQ60598 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CttnQ60598 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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