Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trim38Q5SZ99 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trim38Q5SZ99 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trim38Q5SZ99 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trim38Q5SZ99 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim38Q5SZ99 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim38Q5SZ99 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim38Q5SZ99 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim38Q5SZ99 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim38Q5SZ99 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim38Q5SZ99 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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