Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms