Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms