Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms