Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shank3Q4ACU6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shank3Q4ACU6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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