Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ttc9Q3V038 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ttc9Q3V038 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc9Q3V038 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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