Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms