Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrfip1Q3UZ39 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms