Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms