Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms