Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Acsf3Q3URE1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Acsf3Q3URE1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Acsf3Q3URE1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Acsf3Q3URE1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms