Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5460Q3UQ97 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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